Помимо этого приостановлены действия лицензий по отдельным специальностям на определенные сроки у ряда вузов. В частности, у Северо-Казахстанского государственного университета имени М.Козыбаева - по 5 специальностям; у Жетысуского государственного университета имени И. Жансугурова - по 6 специальностям; у Казахской академии транспорта и коммуникаций имени М.Тынышпаева - по 5 специальностям. Также действие лицензий приостановлено по 15 специальностям у Казахского агротехнического университета имени С. Сейфуллина, по 8 специальностям - у университета «Туран», по 2 специальностям у Таразского государственного университета имени М.Дулати. Лицензии по 4 специальностям приостановлены у Шымкентского университета и по 15 специальностям - у Костанайского социально-технического университета имени З.Алдамжарова. Кроме того, руководство Казахско-русского международного университета привлечено к административной ответственности постановлением специализированного административного суда города Актобе в связи с воспрепятствованием комиссии в проведении проверки.
Кызылординский гуманитарный университет лишен лицензии решением специализированного административного суда города Кызылорды за неустранение нарушений, выявленных комиссией.